堂本一輝是著名的鋼琴演奏家兩年前突然宣布不再演奏鋼琴轉而攻向管風琴更斥資建造了堂本音樂廳準備在落成之日舉行演奏會然而在演奏會之前堂本音樂學院的學生相繼死去先是爆炸案后是單個被殺　　園子帶著柯南一行人來聽排練認識了女高音歌唱家秋庭憐子擁有絕對音感的秋庭也開始遭遇到危險：潤生茶被下藥、作森林浴時遭遇空氣槍襲擊、試演會當天更遭擊暈　　然而就是從這些事件中柯南找到了推理的邏輯：兇手試圖把秋庭排除在兇殺外這邊已經正式開演的演奏會渾然不知音樂大廳外已是爆炸連天小蘭、灰原哀以及演奏廳內的一千多人頓時危在旦夕絕對音感成為了唯一的救命線索柯南找到了爆炸的邏輯要在罪犯引爆最后一個炸彈前把他找出來