圍繞蟹黃堡的神秘配方痞老板和蟹老板展開了新一輪的戰爭雖然海綿寶寶成功挫敗痞老板的猛烈攻勢但是卻依然中了對方的詭計關鍵時刻配方憑空消失直接后果便是導致沒人能再做出蟹黃堡對于日常極度依賴蟹黃堡的比奇堡的居民來說這一消息無異于晴天霹靂小鎮的寧靜蕩然無存海底世界陷入末世般的混亂與動蕩之中由于搭救了痞老板海綿寶寶被大家當作叛徒對待危機時刻海綿寶寶、派大星、痞老板、蟹老板、松鼠珊蒂、章魚哥得以穿越時空并順著蟹黃堡的香味來到了人頭攢動的沙灘上 在那里他們遇見了利用詭計偷走秘方的胡子海盜（安東尼奧·班德拉斯 Antonio Banderas 飾）于是一場蟹黃堡的攻防戰由此展開……